Du 3 au 5 novembre 2014, à la Station Biologique de Roscoff

Objectifs de la formation

Ce projet a pour premier objectif de former des ingénieurs bio-informaticiens à ce nouvel environnement qu’est Galaxy. Il a pour deuxième objectif de favoriser la fédération des communautés, et d’apporter une pierre à la structuration de la bio-informatique au niveau national.

L’école s’articulera autour de 4 axes principaux :

  • Présentation des concepts de workflows et de l'architecture de Galaxy ;
  • Ateliers sur les bonnes pratiques de développements et d’intégration d'outils ;
  • Atelier "Toolshed" ou entrepôt d'outils Galaxy ;
  • Perspectives: interopérabilité, API, web services, etc.

 

Public concerné

Le public concerné correspond aux corps des ingénieurs (développeurs d’applications, bio-informaticiens) des plateformes et des laboratoires, qui pourront également à leur tour contribuer à la dynamique de la communauté Galaxy. Ces ingénieurs sont aujourd’hui les principaux acteurs dans le processus de mise à disposition de la plateforme Galaxy dans les laboratoires, ou dans le cadre de projets d’infrastructures nationaux (IFB, EMBRC-France, METABOHUB).

Comité Scientifique

Chargés d'élaborer ce projet :

CARON Christophe (CNRS / ABiMS)
DUFAYARD Jean François (CIRAD / SouthGreen)
GIACOMONI Franck (INRA / METABOHUB)
GRANGE Thierry (CNRS / ITMO GGB)
INIZAN Olivier (INRA / URGI)
LERMINE Alban (INSERM / Institut Curie)
MAMAN Sarah (INRA / SIGENAE)
MICHEL Gurvan (CNRS / UMR 7139)
SAMSON Franck (INRA / MIG)

Intervenants

G. Andres, C. Caron, A. Cormier, A. Dereeper, S. Derozier, O. Doppelt-Azeroual, JF. Dufayard, O. Inizan, G. Le Corguillé, A. Lermine, F. Mareuil, M. Monsoor, B. Pitollat, F. Samson

Dates & Lieu

La formation aura lieu du 3 au 5 novembre à la Station Biologique de Roscoff.

Rendez-vous dans l'onglet Informations pratiques pour de plus amples informations.